財團法人高等教育評鑑中心基金會（以下簡稱本會）為強化評鑑作業之公正性與專業性，於98年導入ISO 9001品質管理系統，並於104年導入ISO 27001資訊安全管理系統，持續通過驗證，以提升品質管理及資訊安全管理效能。

依《財團法人法》規定，本會於110年完成內部控制制度之建置，並自111年起執行內部控制制度之內部稽核。

為提升整體品質管理之效率與一致性，本會於114年終止ISO 9001品質管理系統驗證，相關管理作業持續透過內部控制制度辦理。

本會於115年持續通過ISO 27001資訊安全管理系統驗證，資通安全政策為「提升資安意識、控制資安風險、落實資通安全、確保持續營運」。