為了替大學攬才、留才，教育部決定以年薪上看650萬元的大手筆聘請千名玉山學者，消息一出震撼學術界，也掀起討論熱潮。國立臺灣師範大學校長張國恩接受《評鑑雙月刊》專訪時肯定政府作為，更建議進一步鬆綁大學經費管制，開放各校運用自籌經費為教師普遍加薪，讓大學教師待遇不再校校齊一。

張國恩也呼籲政府勿以高教深耕計畫將大學的國際競爭力兩極化，以免自毀臺灣大學的國際形象，更不宜為了挽救瀕臨倒閉私校而拖垮其他大學。政府並應提高中低收入戶學生的學雜費減免額度，容許大學調漲學雜費。在招生制度的改革上，他主張大考及國中會考的題型應增加更多以能力為本的素養題。