教育部於107年度起推動高等教育深耕計畫，第一期（107-111年）以「發展大學多元特色、培育新世代優質人才」為願景，經150餘所大專校院4餘年之推動，強調以學生為主體、教學為核心，並以「落實教學創新」、「提升高教公共性」、「發展學校特色」及「善盡社會責任」為目標，協助各校依本身優勢發展特色，聚焦培養學生核心能力，強化學習成效及提升學生就業競爭力。高教深耕計畫延續進入第二期（112-116年），其願景滾動修正為「型塑具備明確定位及優勢特色之大學，培育符應未來需求及國家發展之人才」。

第二期將延續第一期架構，以兩大部分進行推動，第一部分為「全面性提升大專校院品質及促進高教多元發展」及第二部分為「協助大學追求國際一流地位及發展研究中心」，前者包括主冊、主冊專章（國際化之行政支持系統、資安強化）、附冊（落實大學社會責任實踐計畫）、附錄一（提升高教公共性：完善就學協助機制）與附錄二（提升高教公共性：透過原住民族學生資源中心輔導原住民學生成效），後者包括全校型計畫、特色領域研究中心計畫（摘錄自教育部「高等教育深耕計畫」）。

為建立有品質之書面審查、簡報審查及實地訪評等事宜，並建置「高等教育深耕計畫平臺網站」，據以瞭解各校計畫辦理情形與成效考評，爰自106年起委託本會辦理「高等教育深耕計畫執行之品質管理計畫」，俾使作業更臻完善。

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