財團法人高等教育評鑑中心基金會為執行《教育部認可國內外專業評鑑機構審查作業原則》，特訂定「認可國內外專業評鑑機構審查作業辦法」，國內外專業評鑑機構申請認可者，應於每年三月、六月、九月或十二月向本會提出申請。

 審查流程分成下列三個階段：

一、初核階段：由本會於受理專業評鑑機構申請認可後十日內，依 所應檢附之資料完成初核程序。檢送資料有疏漏者，應通知申 請機構於十日內進行補正。

二、審查階段：由認可委員會進行書面審查作業，本會得請機構代 表列席簡報，必要時進行實地訪視審查。

三、認可決定階段：由認可委員會做出認可結果決定；經認可者， 其結果由本會公告。 

本會應於收受申請書次日起三個月內作出認可與否之決定，必要時得延長一個月，並通知申請者。經本會認可之有效期間至多五年，本會得於有效期間內，由認可委員會進行書面資料檢視或實地訪視。